五四期间,章宗祥备受凌辱,但是仍力保释放被捕的学生;而在抗日战争期间,他拒绝汪伪政权授予的高官厚禄。这样一位颇为正直的人物,生前身后,都因为“卖国贼”的帽子过得惨淡凄凉。
章宗祥被免职后,曾到银行供过职,后长期避居青岛,1942年亦被挂上伪华北政务委员会咨询委员的头衔。抗战时,章宗祥尚能明哲保身。日本投降后,他改名换姓,迁居上海。有人曾在上海看见年过六旬的章宗祥在城隍庙前摆一个写字的小摊子,为他人代写书信,挣钱度日。1949年后不再设摊,而靠在大学任教的儿子赡养。1962年10月病逝于上海,终年83岁。